30 июня 1967 года решением исполнительного комитета Мурманского городского совета депутатов трудящихся создано дошкольное учреждение ясли-сад № 89. Центром раннего развития сад стал 26 августа 1998 года. В мае 2010 года в результате реорганизации путем преобразования детский сад приобрел статус комбинированного вида.
В январе 2015 года на основании постановления администрации города Мурманска детский сад реорганизован путем присоединения к нему детского сада общеразвивающего вида № 88, созданного 27 января 1967 года в качестве ясли-сада № 88 «Репка».
В настоящее время детский сад № 89 имеет два корпуса, расположенных по ул. А. Невского, д. 77 и ул. А. Невского, д. 85.